RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCAF10Q5QP82 559 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNE4Q8WWG9 221 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASSF5Q8WWW0 418 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 FLRT3Q9NZU0 649 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3GLB1Q9Y371 365 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 U3KQV3 271 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN24A6NM45 220 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAN1A2O60476 641 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINA7P05543 415 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAR1AP10644 381 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT20P35900 424 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCTP40126 519 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED21Q13503 144 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 COMTD1Q86VU5 262 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4C3Q8NH37 302 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PMM1Q92871 262 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 NDUFAF4Q9P032 175 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DENRO43583 198 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSPHP78330 225 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDZK1Q5T2W1 519 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 HS3ST5Q8IZT8 346 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF248Q8NDW4 579 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 OSBPL11Q9BXB4 747 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT52Q9Y366 437 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHST2Q9Y4C5 530 aa25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPIPB9F8W1W9 429 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DLGAP1O14490 977 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA10O75578 1167 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPPINO95925 133 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DBIP07108 87 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP4B1P13584 511 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ST13P50502 369 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP12AP54707 1039 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF614Q8N883 585 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PROX1Q92786 737 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASL10BQ96S79 203 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PINK1Q9BXM7 581 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF232Q9UNY5 417 aa25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK10O43240 276 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGT2B11O75310 529 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 UTS2O95399 124 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALDH3A2P51648 485 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHAF1BQ13112 559 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DAG1Q14118 895 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIPK1Q86Z02 1210 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIRT6Q8N6T7 355 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A8Q8TCC7 542 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 WFDC6Q9BQY6 131 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 RLIMQ9NVW2 624 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPM1O60762 260 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCB7O75027 752 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ICOSLGO75144 302 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPM1BO75688 479 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 THBS1P07996 1170 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADRB1P08588 477 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA2P17301 1181 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAR1BP31321 381 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNLIPRP2P54317 469 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF141Q15928 474 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 NHSL2Q5HYW2 709 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF836Q6ZNA1 936 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLIP4Q8N3C7 705 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF347Q96SE7 839 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 REEP1Q9H902 201 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXW4P57775 412 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNC4Q03721 635 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYPD8Q6UX82 237 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC5A8Q8N695 610 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5M3Q8NGP4 307 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBQLN4Q9NRR5 601 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6C70A6NIJ9 312 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNW1P05000 195 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALPLP05186 524 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10-202ENST00000380221 NID1P14543 1247 aa25.47■■□□□ 1.67
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