RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q96NJ1 140 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIMM29Q9BSF4 260 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIMM21Q9BVV7 248 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTTY12Q9BZ98 90 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TREX1Q9NSU2 369 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAS2R1Q9NYW7 299 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PILRBQ9UKJ0 227 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PNMA2Q9UL42 364 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S4R3F8 94 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCTP09848 1927 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MGAMO43451 1857 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DENND4AQ7Z401 1863 aa-2.11□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3TC1Q8TE82 1336 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PP18 115 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3PXD2BA1X283 911 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ODF3BA8MYP8 253 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H0YJW9 148 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBXN8O00124 270 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FXYD1O00168 92 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SGCEO43556 437 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALDH1L1O75891 902 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA0754O94854 1291 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANGPTL1O95841 491 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV1D-33P01593 117 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGKV1-33P01594 117 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC159P0C7I6 412 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF35P13682 527 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PVRP15151 417 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IDSP22304 550 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ME2P23368 584 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CETN2P41208 172 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MSH2P43246 934 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NMUP48645 174 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPL8P62917 257 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf54Q08AI8 447 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GALEQ14376 348 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CPTPQ5TA50 214 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HES3Q5TGS1 186 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM219BQ5XKK7 198 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C11orf63Q6NUN7 778 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RRAGAQ7L523 313 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RRM2BQ7LG56 351 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT74Q7RTS7 529 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MOGAT3Q86VF5 341 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF619Q8N2I2 560 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM156AQ8NDB6 213 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CATSPER1Q8NEC5 780 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WFDC9Q8NEX5 89 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC7A6Q92536 515 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB10Q96DT7 871 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MED8Q96G25 268 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUDCD1Q96RS6 583 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS16Q9NQE7 514 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MCUBQ9NWR8 336 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL36AQ9UHA7 158 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFT52Q9Y366 437 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCN3AQ9NY46 2000 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGEF5Q12774 1597 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0G2JMM0 328 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PPB8 328 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PRS3 328 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR6C70A6NIJ9 312 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC53A6NM62 1247 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A8MVM7 634 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMCO5BA8MYB1 307 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AP3D1O14617 1153 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AQP9O43315 295 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEBLO76041 1014 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NKX2-2O95096 273 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHV3-9P01782 118 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NMBRP28336 390 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTDP43251 543 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STT3AP46977 705 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TPMTP51580 245 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAMP7P51809 220 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EVCP57679 992 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MCL1Q07820 350 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPARCL1Q14515 664 aa-2.13□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms