RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ADOQ96SZ5 270 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ACOT9Q9Y305 439 aa14.52□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ESYT3A0FGR9 886 aa14.51□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC189A1A4V9 331 aa14.51□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SYCE1LA8MT33 242 aa14.51□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 H0YIV9 168 aa14.51□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.51□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.51□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 EMDP50402 254 aa14.5□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.49□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.49□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.49□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 CDK15Q96Q40 435 aa14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IPPKQ9H8X2 491 aa14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.48□□□□□ -0.09
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