RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Galnt18Q8K1B9 622 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35b3Q922Q5 369 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmed9Q99KF1 235 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cypt12Q9DAR6 119 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GhrlQ9EQX0 117 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TapbpQ9R233 465 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mpeg1A1L314 713 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm595A2AF73 655 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sac3d1A6H687 427 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd17E0CYQ0 296 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc149F6V035 524 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nfatc1O88942 717 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AcrP23578 436 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 E330014E10RikQ3UL33 481 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itpripl2Q3UV16 535 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D5Ertd577eQ499F0 481 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a12Q8BH59 677 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smyd4Q8BTK5 799 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Banf2Q8BVR0 90 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TifabQ8JZM6 147 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1232Q8VEX7 311 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr853Q8VGG6 305 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fitm1Q91V79 292 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndel1Q9ERR1 345 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrm3Q9ERZ3 589 aa16.01■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r3dA2AJW4 279 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17026K7N6Z0 213 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2al1oL7MU04 110 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs5O08850 181 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NnmtO55239 264 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgf9P54130 208 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alox12eP55249 662 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfsd2bQ3T9M1 494 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brf2Q3UAW9 420 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35g3Q5F297 340 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pabpc2Q62029 628 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema3bQ62177 748 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfml2aQ8BHP7 681 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a17Q8BJI1 727 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd7Q8BJK1 289 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc187Q8C5V8 958 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr771Q8VFH6 317 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl8a8Q9DAS4 241 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PaicsQ9DCL9 425 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtcflA2APF3 636 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r169L7N275 304 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dscr3O35075 297 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl7a1O54830 266 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CaskO70589 926 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Syn1O88935 706 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr39Q5U431 456 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam26bQ6IMH6 699 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam29Q811Q4 763 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf12l2Q8BGW4 469 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl31Q8BWA5 634 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a29Q8BWG6 551 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1Q8VGI1 314 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr658Q8VGV5 323 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr459Q924H8 314 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rsph9Q9D9V4 276 aa16■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ChadlE9Q7T7 748 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CgaP01216 120 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxd9P28357 339 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pou3f2P31360 445 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 KapP61110 121 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thbs2Q03350 1172 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RflnbQ5SVD0 216 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AY358078Q6UY53 465 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas2r3Q7TQA7 316 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr309Q7TS01 308 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SelenoiQ80TA1 398 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osgin1Q8VC10 478 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr935Q8VG16 308 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asb8Q91ZT9 288 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tinf2Q9QXG9 341 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RfxankQ9Z205 269 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8229K7N749 213 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ucp2P70406 309 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxd1Q01822 328 aa15.99■□□□□ 0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrc3Q5DU56 1064 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 72.3 ms