Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Sema3bQ62177 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sema3bQ62177 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sema3bQ62177 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Sema3bQ62177 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Sema3bQ62177 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sema3bQ62177 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sema3bQ62177 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sema3bQ62177 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Sema3bQ62177 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sema3bQ62177 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sema3bQ62177 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sema3bQ62177 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Sema3bQ62177 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sema3bQ62177 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sema3bQ62177 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema3bQ62177 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema3bQ62177 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema3bQ62177 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema3bQ62177 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sema3bQ62177 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema3bQ62177 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sema3bQ62177 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema3bQ62177 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema3bQ62177 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sema3bQ62177 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sema3bQ62177 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema3bQ62177 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema3bQ62177 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema3bQ62177 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sema3bQ62177 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema3bQ62177 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sema3bQ62177 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema3bQ62177 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema3bQ62177 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sema3bQ62177 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema3bQ62177 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3bQ62177 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema3bQ62177 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema3bQ62177 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema3bQ62177 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema3bQ62177 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema3bQ62177 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema3bQ62177 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema3bQ62177 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema3bQ62177 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema3bQ62177 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema3bQ62177 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema3bQ62177 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sema3bQ62177 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema3bQ62177 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema3bQ62177 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema3bQ62177 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema3bQ62177 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema3bQ62177 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sema3bQ62177 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema3bQ62177 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sema3bQ62177 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema3bQ62177 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema3bQ62177 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema3bQ62177 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema3bQ62177 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema3bQ62177 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema3bQ62177 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema3bQ62177 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema3bQ62177 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema3bQ62177 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema3bQ62177 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema3bQ62177 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema3bQ62177 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sema3bQ62177 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema3bQ62177 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema3bQ62177 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema3bQ62177 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema3bQ62177 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema3bQ62177 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3bQ62177 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3bQ62177 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema3bQ62177 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema3bQ62177 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sema3bQ62177 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3bQ62177 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema3bQ62177 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema3bQ62177 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema3bQ62177 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sema3bQ62177 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3bQ62177 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema3bQ62177 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sema3bQ62177 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema3bQ62177 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema3bQ62177 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema3bQ62177 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema3bQ62177 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3bQ62177 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema3bQ62177 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema3bQ62177 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema3bQ62177 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema3bQ62177 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3bQ62177 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3bQ62177 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms