RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	ARR2	Q06597	130 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	BDS1	Q08347	646 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CTT1	P06115	562 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	DAL7	P21826	554 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PSY4	P38193	441 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SIT1	P39980	628 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YJL070C	P40361	888 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	MRPS18	P42847	217 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	STU2	P46675	888 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YNR068C	P53754	272 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RRN5	Q02983	363 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	MSH6	Q03834	1242 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SHE9	Q04172	456 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	OXR1	Q08952	273 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	BI4	P03879	638 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	STE11	P23561	717 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	AGP1	P25376	633 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ARE1	P25628	610 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PCH2	P38126	564 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SOH1	P38633	127 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RAD55	P38953	406 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	BUD16	P39988	312 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RTC4	P53850	401 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	AEP2	P22136	580 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RSC6	P25632	483 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SWH1	P35845	1188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PBY1	P38254	753 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	EFM2	P38347	419 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CCC2	P38995	1004 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YJL068C	P40363	299 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YJR096W	P47137	282 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PML39	Q03760	334 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CAB1	Q04430	367 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	DAL4	Q04895	635 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CDC9	P04819	755 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	TOP3	P13099	656 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CLC1	P17891	233 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PCL2	P25693	308 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	UIP5	P36137	443 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	DUN1	P39009	513 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	STL1	P39932	569 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	INA22	P40576	216 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	CIR1	P42940	261 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	TFC6	Q06339	672 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RTT10	Q08924	1013 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	VBA3	P25594	458 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ZIM17	P42844	174 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YRM1	Q12340	786 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ENT1	Q12518	454 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	MNE1	P24720	663 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	ISC10	P32645	267 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	MDJ1	P35191	511 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
TUL1	YKL034W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	LAM1	P38851	1228 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RTS1	P38903	757 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	GEM1	P39722	662 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	NPR2	P39923	615 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	HMI1	Q12039	706 aa		5.65	□□□□□ -1.5
TUL1	YKL034W	PRP28	P23394	588 aa		5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	NTG1	P31378	399 aa		5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	VPS17	P32913	551 aa		5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
TUL1	YKL034W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.51	not detected
TUL1	YKL034W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51

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