RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
SLX8	YER116C	YKL107W	P34251	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	JEM1	P40358	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	QDR2	P40474	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YFL066C	P43538	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RET2	P43621	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YGL176C	P46945	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SAE2	P46946	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YAP1802	P53309	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SIW14	P53965	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CTR9	P89105	1077 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ROD1	Q02805	837 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ARA2	Q04212	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	TAH18	Q12181	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	BI4	P03879	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MCM1	P11746	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	PAH1	P32567	862 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SCT1	P32784	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ORC2	P32833	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YEL1	P34225	687 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	SEG2	P34250	1132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MCM7	P38132	845 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YIL166C	P40445	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	DJP1	P40564	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ALG2	P43636	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	JJJ2	P46997	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YML6	P51998	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	TIM10	P87108	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	CIA1	Q05583	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLX8	YER116C	STF1	P01098	86 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MDJ1	P35191	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YEL068C	P39977	110 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	VHR1	P40522	640 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	VPS53	P47061	822 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YGR153W	P48238	217 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	AIM14	P53109	570 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	SLD3	P53135	668 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	TAF11	Q04226	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	ESC8	Q08119	714 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	THI72	Q08579	599 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	RKM4	Q12504	494 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	QCR6	P00127	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MET8	P15807	274 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MSH1	P25846	959 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	DBF4	P32325	704 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YKU70	P32807	602 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	PET10	P36139	283 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	BSD2	P38356	321 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	SIT1	P39980	628 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	EMP65	P40085	556 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	RAD26	P40352	1085 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	PMT7	Q06644	662 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	MDM38	Q08179	573 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	PEX15	Q08215	383 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	RPC53	P25441	422 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SLX8	YER116C	SLC1	P33333	303 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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