RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 NTSR2O95665 410 aa21.89■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 APLP1P51693 650 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 ST5P78524 1137 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 NYXQ9GZU5 481 aa21.89■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.88■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.87■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 ABCC12Q96J65 1359 aa21.87■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 SYNE4Q8N205 404 aa21.85■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.85■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.85■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 A0A0G2JLW4 131 aa21.83■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 LINS1Q8NG48 757 aa21.83■■□□□ 1.09
CLN6-218ENST00000637223 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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CLN6-218ENST00000637223 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN6-218ENST00000637223 CACNA1FO60840 1977 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN6-218ENST00000637223 PDE6BP35913 854 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN6-218ENST00000637223 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.82■■□□□ 1.08
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CLN6-218ENST00000637223 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN6-218ENST00000637223 TOMM70O94826 608 aa21.81■■□□□ 1.08
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CLN6-218ENST00000637223 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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CLN6-218ENST00000637223 BCS1LQ9Y276 419 aa21.72■■□□□ 1.07
CLN6-218ENST00000637223 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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CLN6-218ENST00000637223 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CLN6-218ENST00000637223 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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