RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPT3	Q9UH03	358 aa		7.13	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	F11	P03951	625 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP4A	P20648	1035 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK1	P28482	360 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ECM1	Q16610	540 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	NES	P48681	1621 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ICMT	O60725	284 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ABL1	P00519	1130 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.12	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	RTN1	Q16799	776 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO19	Q96H55	970 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		7.11	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM2	Q13029	1718 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	COX20	Q5RI15	118 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf46	Q6P387	395 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.09	□□□□□ -1.27
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PNR3	127 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGA6	P23229	1130 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	CERS3	Q8IU89	383 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	DBN1	Q16643	649 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.08	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C1W4	665 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	THBS1	P07996	1170 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	HIF1A	Q16665	826 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	EFHC2	Q5JST6	749 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.06	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	MARCH6	O60337	910 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	VEGFB	P49765	207 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms