RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	GPR152	Q8TDT2	470 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.55	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538		H7C1W4	665 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	GPR182	O15218	404 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	VAMP1	P23763	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.54	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	OPLAH	O14841	1288 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	TYRO3	Q06418	890 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.53	□□□□□ -1.2
EP300-208	ENST00000635538	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	MAPK8	P45983	427 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	EGFR	P00533	1210 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	KCNQ4	P56696	695 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	PTS	Q03393	145 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.48	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	EFS	O43281	561 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	XYLB	O75191	536 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
EP300-208	ENST00000635538	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.46	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PHACTR2	O75167	634 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.45	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	GIPC1	O14908	333 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	GNA15	P30679	374 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	DAB2	P98082	770 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TNP2	Q05952	138 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ORC1	Q13415	861 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	CCIN	Q13939	588 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	DACH1	Q9UI36	760 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	USP20	Q9Y2K6	914 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538		A6NHS1	94 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	SORBS3	O60504	671 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	ITGA6	P23229	1130 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	PSMD2	Q13200	908 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EP300-208	ENST00000635538	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22

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