RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF10A6NK89 507 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CRY2Q49AN0 593 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 GPTP24298 496 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 LARGE2Q8N3Y3 721 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL6BP14649 208 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SNED1Q8TER0 1413 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMB4A4D0S4 1761 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM1Q13255 1194 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIPAP1Q4V328 841 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 EPS15P42566 896 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SUSD4Q5VX71 490 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NIM1KQ8IY84 436 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 UBN2Q6ZU65 1347 aa36.22■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A5P29400 1685 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SCNN1DP51172 638 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-217ENST00000629983 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC51AQ86UW1 340 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.19■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 RIC1Q4ADV7 1423 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIP5K2O43314 1243 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 BEGAINQ9BUH8 593 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPNS2Q96L46 248 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 NTSR2O95665 410 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ECE1P42892 770 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa36.16■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD8Q96I13 439 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 AOC3Q16853 763 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf67Q6ZVT6 689 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF34Q8IZ26 560 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 LTBP1Q14766 1721 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF5O00463 557 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP3Q96P20 1036 aa36.13■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NFE2L2Q16236 605 aa36.12■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP10Q53GL7 1025 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM3BQ7LBC6 1761 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP98P52948 1817 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ERBB4Q15303 1308 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SUPT20HQ8NEM7 779 aa36.07■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPYL4Q9UJ04 414 aa36.07■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CST9Q5W186 159 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TLL2Q9Y6L7 1015 aa36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC4O15439 1325 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS33BQ9H267 617 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNRF3Q9ULT6 936 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL9Q07325 125 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF2O95319 508 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM161AQ3B820 660 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TSKSQ9UJT2 592 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 AOC2O75106 756 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC85CA6NKD9 419 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA1P04083 346 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 THSD7BQ9C0I4 1608 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 CIAPIN1Q6FI81 312 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MPNDQ8N594 471 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A5Q5PT55 438 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 PROSER3Q2NL68 480 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 BBOX1O75936 387 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD17O75943 681 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP2K2P36507 400 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-217ENST00000629983 PDIA6Q15084 440 aa35.96■■■■□ 3.35
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