RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 SYNE4Q8N205 404 aa29■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 JDP2Q8WYK2 163 aa29■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 RIC1Q4ADV7 1423 aa29■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 ABCC12Q96J65 1359 aa29■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 ERBB4Q15303 1308 aa28.99■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 RIPK4P57078 832 aa28.99■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 CRY2Q49AN0 593 aa28.99■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 NYXQ9GZU5 481 aa28.99■■■□□ 2.23
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SRRT-218ENST00000620394 LTBP1Q14766 1721 aa28.99■■■□□ 2.23
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SRRT-218ENST00000620394 HLFQ16534 295 aa28.98■■■□□ 2.23
SRRT-218ENST00000620394 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.98■■■□□ 2.23
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SRRT-218ENST00000620394 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.97■■■□□ 2.23
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SRRT-218ENST00000620394 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.96■■■□□ 2.23
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SRRT-218ENST00000620394 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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SRRT-218ENST00000620394 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.92■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.92■■■□□ 2.22
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SRRT-218ENST00000620394 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.91■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.9■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 RUNDC1Q96C34 613 aa28.9■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.9■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 MYL6BP14649 208 aa28.89■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SRRT-218ENST00000620394 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.89■■■□□ 2.22
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SRRT-218ENST00000620394 SCNN1DP51172 638 aa28.88■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 PDIA6Q15084 440 aa28.88■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.88■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.87■■■□□ 2.21
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SRRT-218ENST00000620394 ABHD8Q96I13 439 aa28.86■■■□□ 2.21
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SRRT-218ENST00000620394 CAPNS2Q96L46 248 aa28.83■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.83■■■□□ 2.21
SRRT-218ENST00000620394 GPTP24298 496 aa28.82■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 EPS15P42566 896 aa28.82■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 NEUROD2Q15784 382 aa28.82■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 PROSER3Q2NL68 480 aa28.82■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 NTSR2O95665 410 aa28.8■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 SUSD4Q5VX71 490 aa28.8■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.79■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 PPIP5K2O43314 1243 aa28.78■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 PARP10Q53GL7 1025 aa28.78■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 VPS33BQ9H267 617 aa28.78■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 LAMB2P55268 1798 aa28.78■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 ANXA1P04083 346 aa28.77■■■□□ 2.2
SRRT-218ENST00000620394 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
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SRRT-218ENST00000620394 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.77■■■□□ 2.2
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SRRT-218ENST00000620394 HOXB7P09629 217 aa28.76■■■□□ 2.19
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SRRT-218ENST00000620394 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.76■■■□□ 2.19
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SRRT-218ENST00000620394 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
SRRT-218ENST00000620394 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.74■■■□□ 2.19
SRRT-218ENST00000620394 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.74■■■□□ 2.19
SRRT-218ENST00000620394 CFAP44Q96MT7 982 aa28.74■■■□□ 2.19
SRRT-218ENST00000620394 NLRP3Q96P20 1036 aa28.74■■■□□ 2.19
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