RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619529.1

LINC00854-215, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-215	ENST00000619529	MYL6B	P14649	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	GPT	P24298	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	PDIA6	Q15084	440 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	GPC2	Q8N158	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	NUP98	P52948	1817 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	NTSR2	O95665	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.58	□□□□□ -0.23
LINC00854-215	ENST00000619529	EPS15	P42566	896 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	SCNN1D	P51172	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	ANXA1	P04083	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	NEFM	P07197	916 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	LBX1	P52954	281 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	CST9	Q5W186	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	TRAF5	O00463	557 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	AOC3	Q16853	763 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00854-215	ENST00000619529	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	RIPK4	P57078	832 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	CXCL9	Q07325	125 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	ABCC4	O15439	1325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	BBOX1	O75936	387 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	CHL1	O00533	1208 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LINC00854-215	ENST00000619529	MPND	Q8N594	471 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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