RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	CHL1	O00533	1208 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	PARP10	Q53GL7	1025 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	COPS6	Q7L5N1	327 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	KLRG1	Q96E93	195 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	POTEI	P0CG38	1075 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	POTEJ	P0CG39	1038 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	SYNE4	Q8N205	404 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-222	ENST00000597718	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF428	Q96B54	188 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	COL4A5	P29400	1685 aa		18.38	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	PSMD1	Q99460	953 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	NLRP10	Q86W26	655 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	NLRP3	Q96P20	1036 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	PCNT	O95613	3336 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	SCN4A	P35499	1836 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	ABCC4	O15439	1325 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	FZD9	O00144	591 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	APAF1	O14727	1248 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	TCIRG1	Q13488	830 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	JMY	Q8N9B5	988 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	CFAP44	Q96MT7	982 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	LAMB2	P55268	1798 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	HOXB7	P09629	217 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	EPHX2	P34913	555 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	MIER1	Q8N108	512 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	GPC2	Q8N158	579 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	AOC3	Q16853	763 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC184	Q52MB2	194 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	IFT57	Q9NWB7	429 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	HYPK	Q9NX55	129 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	GNAI1	P63096	354 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	FAM89A	Q96GI7	184 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	CREBZF	Q9NS37	354 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-222	ENST00000597718	TAF1	P21675	1872 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	PASK	Q96RG2	1323 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	GRAP	Q13588	217 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	BBOX1	O75936	387 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51

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