RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRS-208ENST00000590509 NUP98P52948 1817 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-208ENST00000590509 CRY2Q49AN0 593 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-208ENST00000590509 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRS-208ENST00000590509 NGEFQ8N5V2 710 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRS-208ENST00000590509 RGS19P49795 217 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRS-208ENST00000590509 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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PTPRS-208ENST00000590509 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRS-208ENST00000590509 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRS-208ENST00000590509 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRS-208ENST00000590509 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.46■■□□□ 1.03
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PTPRS-208ENST00000590509 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 ZIC5Q96T25 663 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 ECE1P42892 770 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.42■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
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PTPRS-208ENST00000590509 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF428Q96B54 188 aa21.32■■□□□ 1
PTPRS-208ENST00000590509 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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PTPRS-208ENST00000590509 PROSER3Q2NL68 480 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRS-208ENST00000590509 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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