RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
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SMAD4-211ENST00000590499 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.8□□□□□ -0.04
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SMAD4-211ENST00000590499 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.78□□□□□ -0.04
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SMAD4-211ENST00000590499 RGS20O76081 388 aa14.76□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 PDE4AP27815 886 aa14.76□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.75□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.75□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.75□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 TBC1D12O60347 775 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 DDR1Q08345 913 aa14.74□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.74□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 CHD4Q14839 1912 aa14.74□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 ZPR1O75312 459 aa14.73□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 TM4SF1P30408 202 aa14.73□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.72□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 A0A087WZG4 1122 aa14.72□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.72□□□□□ -0.05
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SMAD4-211ENST00000590499 NEUROD2Q15784 382 aa14.71□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 NBPF15Q8N660 670 aa14.71□□□□□ -0.05
SMAD4-211ENST00000590499 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.066e-8■■□□□ 12.3
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SMAD4-211ENST00000590499 NFIXQ14938 502 aa14.7□□□□□ -0.06
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SMAD4-211ENST00000590499 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.7□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.7□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 CAMTA2O94983 1202 aa14.69□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 GPR162Q16538 588 aa14.69□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.69□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 CHL1O00533 1208 aa14.68□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 APAF1O14727 1248 aa14.68□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.68□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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SMAD4-211ENST00000590499 TGFB2P61812 414 aa14.67□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 MRS2Q9HD23 443 aa14.67□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.66□□□□□ -0.06
SMAD4-211ENST00000590499 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.66□□□□□ -0.06
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SMAD4-211ENST00000590499 OXER1Q8TDS5 423 aa14.65□□□□□ -0.06
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SMAD4-211ENST00000590499 ERBB4Q15303 1308 aa14.65□□□□□ -0.06
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SMAD4-211ENST00000590499 GRIN3BO60391 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 SERPINB2P05120 415 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF853P0CG23 659 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 DPEP1P16444 411 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 KCNA3P22001 575 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 YY1P25490 414 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.64□□□□□ -0.07
SMAD4-211ENST00000590499 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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