RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 IFFO2Q5TF58 517 aa36.9■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.9■■■■□ 3.5
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.88■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.88■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KRT24Q2M2I5 525 aa36.88■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 COPS6Q7L5N1 327 aa36.87■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 POTEJP0CG39 1038 aa36.86■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C3orf67Q6ZVT6 689 aa36.86■■■■□ 3.49
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 JMYQ8N9B5 988 aa36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NLRP3Q96P20 1036 aa36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.84■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.84■■■■□ 3.491e-7■□□□□ 8.3
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 JDP2Q8WYK2 163 aa36.81■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FZD9O00144 591 aa36.8■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.8■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GRIPAP1Q4V328 841 aa36.79■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC10A5Q5PT55 438 aa36.79■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.79■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.79■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC51AQ86UW1 340 aa36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NLRP10Q86W26 655 aa36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LDHDQ86WU2 507 aa36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HACL1Q9UJ83 578 aa36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TCIRG1Q13488 830 aa36.76■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CFAP44Q96MT7 982 aa36.75■■■■□ 3.47
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GPC2Q8N158 579 aa36.74■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LARGE2Q8N3Y3 721 aa36.74■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EPHX2P34913 555 aa36.73■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EIF6P56537 245 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CREBZFQ9NS37 354 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CLEC11AQ9Y240 323 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa36.71■■■■□ 3.47
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MBIPQ9NS73 344 aa36.7■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 APAF1O14727 1248 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PLBD2Q8NHP8 589 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZNF428Q96B54 188 aa36.69■■■■□ 3.46
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PASKQ96RG2 1323 aa36.65■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BBOX1O75936 387 aa36.65■■■■□ 3.46
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HYPKQ9NX55 129 aa36.65■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.64■■■■□ 3.46
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TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 IFT57Q9NWB7 429 aa36.63■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SUPT20HQ8NEM7 779 aa36.62■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GNAI1P63096 354 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GRAPQ13588 217 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SP8Q8IXZ3 490 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.61■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 VPS33BQ9H267 617 aa36.6■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TAF1P21675 1872 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MPNDQ8N594 471 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM89AQ96GI7 184 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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