RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ASB16Q96NS5 453 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 KLK14Q9P0G3 267 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 SCARF1Q14162 830 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ABTB2Q8N961 1025 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 KLRG1Q96E93 195 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 BCS1LQ9Y276 419 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 PKDCCQ504Y2 493 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 AIDAQ96BJ3 306 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 IFT43Q96FT9 208 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 AXIN1O15169 862 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ATP4AP20648 1035 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP42Q96MM3 310 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 CITED4Q96RK1 184 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFB5O43674 189 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 RHOQP17081 205 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 MSX1P28360 303 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 ATCAYQ86WG3 371 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 GIPC2Q8TF65 315 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 SUSD3Q96L08 255 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-208ENST00000578600 CD109Q6YHK3 1445 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRM-208ENST00000578600 UNCXA6NJT0 531 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ZAP70P43403 619 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 TMC7Q7Z402 723 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 TREML1Q86YW5 311 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ZIC5Q96T25 663 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 TSPOAP1O95153 1857 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 COL19A1Q14993 1142 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 HIF1AQ16665 826 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 IER5Q5VY09 327 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 FAM129BQ96TA1 746 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 CUL7Q14999 1698 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 OPLAHO14841 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ST8SIA5O15466 376 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 MICAL2O94851 1124 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 AAMPQ13685 434 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 GJD3Q8N144 294 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 BCL11AQ9H165 835 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 PDGFAP04085 211 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 DSC3Q14574 896 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 EDEM1Q92611 657 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRM-208ENST00000578600 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 DACH1Q9UI36 760 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PNR3 127 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 GPR182O15218 404 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 F11P03951 625 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-208ENST00000578600 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.53□□□□□ -1.04
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