RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.49■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 MYL6BP14649 208 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 JDP2Q8WYK2 163 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.48■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 NEFMP07197 916 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 CNTROBQ8N137 903 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.47■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 SUSD4Q5VX71 490 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 LAMB2P55268 1798 aa20.46■□□□□ 0.87
SPNS2-208ENST00000576635 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 NFE2L2Q16236 605 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 AIDAQ96BJ3 306 aa20.45■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 RASSF10A6NK89 507 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 NTSR2O95665 410 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.44■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 WBP1LQ9NX94 342 aa20.43■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 SCNN1DP51172 638 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.42■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 EPS15P42566 896 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 ERBB4Q15303 1308 aa20.41■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 LBX1P52954 281 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 TAF1P21675 1872 aa20.39■□□□□ 0.86
SPNS2-208ENST00000576635 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PDIA6Q15084 440 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 NIM1KQ8IY84 436 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PPIP5K2O43314 1243 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 ANXA1P04083 346 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 AOC3Q16853 763 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PROSER3Q2NL68 480 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PARP10Q53GL7 1025 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 NLRP3Q96P20 1036 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 ABCC4O15439 1325 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 TRAF5O00463 557 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 CST9Q5W186 159 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 CAPNS2Q96L46 248 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS2-208ENST00000576635 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 RIPK4P57078 832 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 CXCL9Q07325 125 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 GRM1Q13255 1194 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 NECTIN2Q92692 538 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 VPS33BQ9H267 617 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 COPS6Q7L5N1 327 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 NLRP10Q86W26 655 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 ECE1P42892 770 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 SP8Q8IXZ3 490 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 MPNDQ8N594 471 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS2-208ENST00000576635 BBOX1O75936 387 aa20.28■□□□□ 0.84
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