RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562311.5

KIFC3-209, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-209	ENST00000562311	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		33.17	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	COPS6	Q7L5N1	327 aa		33.16	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.15	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	LAMB2	P55268	1798 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
KIFC3-209	ENST00000562311	ALDH1B1	P30837	517 aa		33.13	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		33.13	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	KLRG1	Q96E93	195 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.1	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		33.1	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.09	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	MBIP	Q9NS73	344 aa		33.08	■■■□□ 2.89
KIFC3-209	ENST00000562311	APAF1	O14727	1248 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	COL4A1	P02462	1669 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	FZD9	O00144	591 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	PSMD1	Q99460	953 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	LTBP1	Q14766	1721 aa		33.05	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	SCN4A	P35499	1836 aa		33.04	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		33.04	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	ABCC4	O15439	1325 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	TAF1	P21675	1872 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF853	P0CG23	659 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	JMY	Q8N9B5	988 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	CHADL	Q6NUI6	762 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KIFC3-209	ENST00000562311	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	PCNT	O95613	3336 aa		33	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	HOXB7	P09629	217 aa		32.97	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.95	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.95	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.95	■■■□□ 2.87
KIFC3-209	ENST00000562311	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.94	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	EPHX2	P34913	555 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	AOC3	Q16853	763 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	GPC2	Q8N158	579 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.91	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.91	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.91	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		32.89	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	SCNN1D	P51172	638 aa		32.89	■■■□□ 2.86
KIFC3-209	ENST00000562311	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.88	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	TSPYL6	Q8N831	410 aa		32.87	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.87	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	EPS15	P42566	896 aa		32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	GRAP	Q13588	217 aa		32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.86	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	GNAI1	P63096	354 aa		32.85	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.84	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.84	■■■□□ 2.85

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