RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 MEN1O00255 615 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 IGSF3O75054 1194 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 POU4F2Q12837 409 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NR6A1Q15406 480 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 RGS12O14924 1447 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM66O15016 1216 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM52Q96A61 297 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ITGB7P26010 798 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 MAP2K3P46734 347 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 KIF15Q9NS87 1388 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.96□□□□□ -1.13
TMOD3-209ENST00000561136 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ZFYVE9O95405 1425 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 LCE3BQ5TA77 95 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 CD163Q86VB7 1156 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 EP400Q96L91 3159 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ERBINQ96RT1 1412 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 GPC1P35052 558 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF15Q8N660 670 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 KLRG1Q96E93 195 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 JCADQ9P266 1359 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC5O15440 1437 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 NOS1P29475 1434 aa7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 UNC13BO14795 1591 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 E9PCH4 1651 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1W2PRU2 124 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ESPNB1AK53 854 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 AMPD1P23109 780 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 DAPK1P53355 1430 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 CHRNA4P43681 627 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 DOC2BQ14184 412 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 MSH6P52701 1360 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 F11P03951 625 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP3Q96P20 1036 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRUQ92729 1446 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 TRPM2O94759 1503 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 THBS1P07996 1170 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 KCNA6P17658 529 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-209ENST00000561136 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 IDI1Q13907 227 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms