RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556240.1

GPHN-212, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 3

Gene GPHN, Length 404 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-212ENST00000556240 CEP63Q96MT8 703 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 BRD7Q9NPI1 651 aa7.25□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ADH7P40394 386 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 DPYDQ12882 1025 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PTK7Q13308 1070 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.24□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 SFI1A8K8P3 1242 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 FAM229AH3BQW9 127 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 APBA3O96018 575 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ALBP02768 609 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 TYRO3Q06418 890 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 POTEAQ6S8J7 498 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 SUSD3Q96L08 255 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.23□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ITGB7P26010 798 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 CDCA8Q53HL2 280 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GPHN-212ENST00000556240 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 KCNQ4P56696 695 aa7.21□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 C21orf2O43822 256 aa7.2□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.2□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 BHMTQ93088 406 aa7.2□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.2□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 DKK1O94907 266 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ATG7O95352 703 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 NID1P14543 1247 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 HIF1AQ16665 826 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 NGLY1Q96IV0 654 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.19□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 NACC1Q96RE7 527 aa7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.18□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 IGFBP4P22692 258 aa7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 IGFLR1Q9H665 355 aa7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.17□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 LILRB5O75023 590 aa7.16□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 GRIK4Q16099 956 aa7.16□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.16□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.16□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.16□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 FOXO3O43524 673 aa7.15□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.15□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 ARXQ96QS3 562 aa7.15□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GPHN-212ENST00000556240 PNMA5Q96PV4 448 aa7.14□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 DYRK3O43781 588 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 LGR5O75473 907 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 RTN1Q16799 776 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 IER5Q5VY09 327 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 NUDT8Q8WV74 236 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 EFCC1Q9HA90 598 aa7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 A0A0A0MRY4 1105 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 NFKB1P19838 968 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 RAC1P63000 192 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 GSX2Q9BZM3 304 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 C9orf172C9J069 976 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 ELNP15502 786 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 WEE1P30291 646 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 PDE4CQ08493 712 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 CCINQ13939 588 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 ARID3AQ99856 593 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 NAGPAQ9UK23 515 aa7.11□□□□□ -1.27
GPHN-212ENST00000556240 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.11□□□□□ -1.27
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