RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555068.1

AC004825.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004825.1, Length 586 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004825.1-201ENST00000555068 PRR20BP86481 221 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PRR20AP86496 221 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 NCOA4Q13772 614 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.06□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 EML3Q32P44 896 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.05□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 J3QL48 77 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 NNTQ13423 1086 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.04□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 LAMC1P11047 1609 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 CLTCL1P53675 1640 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 NR3C2P08235 984 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 RGL3Q3MIN7 710 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 SIRT1Q96EB6 747 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.03□□□□□ -1.12
AC004825.1-201ENST00000555068 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 USP4Q13107 963 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 VPS72Q15906 364 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 NOD1Q9Y239 953 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 NAIPQ13075 1403 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.02□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 MYOM2P54296 1465 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SMPD1P17405 629 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 CDCA8Q53HL2 280 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 POGKQ9P215 609 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ARHGEF10O15013 1369 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 KIF1AQ12756 1690 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 TRIM50Q86XT4 487 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 CYLDQ9NQC7 956 aa8□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 PPLO60437 1756 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SCTRP47872 440 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ERVK-9P63128 1117 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 PXDNQ92626 1479 aa7.99□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 RASA1P20936 1047 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ATP1A2P50993 1020 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SLIT2O94813 1529 aa7.98□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 USP32Q8NFA0 1604 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 LILRA1O75019 489 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 GTF2IP78347 998 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 OGFOD1Q8N543 542 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 HPS1Q92902 700 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 BTG4Q9NY30 223 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 GLI3P10071 1580 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 ABCC11Q96J66 1382 aa7.97□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 LRP5O75197 1615 aa7.96□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 PRAG1Q86YV5 1406 aa7.96□□□□□ -1.13
AC004825.1-201ENST00000555068 FAM187AA6NFU0 413 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004825.1-201ENST00000555068 FAM196BA6NMK8 535 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004825.1-201ENST00000555068 ATG7O95352 703 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004825.1-201ENST00000555068 EVA1CP58658 441 aa7.96□□□□□ -1.14
AC004825.1-201ENST00000555068 PDE3BQ13370 1112 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms