RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ITGB7P26010 798 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 DOC2BQ14184 412 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 BRD7Q9NPI1 651 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 SOGA1O94964 1423 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 TYRO3Q06418 890 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 SUSD3Q96L08 255 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 CEP63Q96MT8 703 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 M0R082 166 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ALBP02768 609 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 FAM229AH3BQW9 127 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ADH7P40394 386 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 KCNQ4P56696 695 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-205ENST00000546248 CFTRP13569 1480 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 GATA4P43694 442 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 Q8N3U1 123 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 GLMNQ92990 594 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 NID1P14543 1247 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 RASA1P20936 1047 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 NEUROD1Q13562 356 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 BHMTQ93088 406 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 EEA1Q15075 1411 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 NGLY1Q96IV0 654 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 SYNJ1O43426 1573 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 LGR5O75473 907 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 SEC13P55735 322 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 APBA3O96018 575 aa8.53□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.53□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 ARID3AQ99856 593 aa8.53□□□□□ -1.04
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 GRIK4Q16099 956 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 BCS1LQ9Y276 419 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 PTK7Q13308 1070 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 HINFPQ9BQA5 517 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 IGFLR1Q9H665 355 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 LILRB5O75023 590 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 DPYDQ12882 1025 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 HIF1AQ16665 826 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 RTN1Q16799 776 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 IER5Q5VY09 327 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 GSX2Q9BZM3 304 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 NUDT8Q8WV74 236 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 NAGPAQ9UK23 515 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 CUX1P39880 1505 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TOP2BQ02880 1626 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L15C9J2P7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L10C9JJH3 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L12C9JPN9 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L11C9JVI0 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L21D6R901 530 aa8.47□□□□□ -1.05
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