RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP3Q96P20 1036 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 POTECB2RU33 542 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF26B4DH59 902 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 LMNB1P20700 586 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF15Q8N660 670 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 MBIPQ9NS73 344 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PASKQ96RG2 1323 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SRGNP10124 158 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNA5P30532 468 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 COPS6Q7L5N1 327 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TMC4Q7Z404 712 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 WWC1Q8IX03 1113 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 LTBP1Q14766 1721 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM177BA6PVY3 158 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF853P0CG23 659 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TCIRG1Q13488 830 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 HLFQ16534 295 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC93Q567U6 631 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CHADLQ6NUI6 762 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NECTIN2Q92692 538 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SCN4AP35499 1836 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CCER2I3L3R5 266 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 BBOX1O75936 387 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 GPTP24298 496 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 JDP2Q8WYK2 163 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS33BQ9H267 617 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF10A6NK89 507 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 C21orf2O43822 256 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PDIA6Q15084 440 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CRY2Q49AN0 593 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ERFEQ4G0M1 354 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF428Q96B54 188 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SCN7AQ01118 1682 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 SUSD4Q5VX71 490 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 KSR2Q6VAB6 950 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP10Q86W26 655 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMD1Q99460 953 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-215ENST00000544584 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.15□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 E9PSI1 815 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 NTSR2O95665 410 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A2P04920 1241 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF7Q02833 373 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 PROSER3Q2NL68 480 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-215ENST00000544584 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.14□□□□□ -1.27
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