RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 HTRA3P83110 453 aa24.46■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 CHADLQ6NUI6 762 aa24.46■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 NGEFQ8N5V2 710 aa24.46■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 RUNDC1Q96C34 613 aa24.46■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 FAM177BA6PVY3 158 aa24.45■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.45■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 GPTP24298 496 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 OLFM4Q6UX06 510 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 LDHDQ86WU2 507 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 SYNE4Q8N205 404 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 VPS33BQ9H267 617 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 PASKQ96RG2 1323 aa24.42■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 PROSER3Q2NL68 480 aa24.42■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 GPC2Q8N158 579 aa24.42■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 CREBZFQ9NS37 354 aa24.42■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.41■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 NLRP3Q96P20 1036 aa24.4■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 COL4A5P29400 1685 aa24.4■■□□□ 1.5
LTBR-211ENST00000543190 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 JDP2Q8WYK2 163 aa24.39■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 HACL1Q9UJ83 578 aa24.39■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.39■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 POTEIP0CG38 1075 aa24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 POTEJP0CG39 1038 aa24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 TCIRG1Q13488 830 aa24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 COPS6Q7L5N1 327 aa24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 CFAP44Q96MT7 982 aa24.38■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 NLRP10Q86W26 655 aa24.37■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.37■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.37■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.36■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 BBOX1O75936 387 aa24.35■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.35■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 LTBP1Q14766 1721 aa24.35■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 ANXA1P04083 346 aa24.34■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 ZNF853P0CG23 659 aa24.34■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 EPHX2P34913 555 aa24.34■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.34■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.33■■□□□ 1.49
LTBR-211ENST00000543190 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 NEUROD2Q15784 382 aa24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TMC4Q7Z404 712 aa24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 SP8Q8IXZ3 490 aa24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 ABCC4O15439 1325 aa24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.32■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TAF1P21675 1872 aa24.31■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 KRT24Q2M2I5 525 aa24.31■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.31■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 CNTNAP1P78357 1384 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 HYPKQ9NX55 129 aa24.3■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.29■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.29■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 SCNN1DP51172 638 aa24.28■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 IFT57Q9NWB7 429 aa24.28■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.27■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 MBIPQ9NS73 344 aa24.27■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.27■■□□□ 1.48
LTBR-211ENST00000543190 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.26■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.26■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 NIM1KQ8IY84 436 aa24.26■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 NECTIN2Q92692 538 aa24.26■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 GNAI1P63096 354 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 GRAPQ13588 217 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 CNTROBQ8N137 903 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 PPIP5K2O43314 1243 aa24.24■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
LTBR-211ENST00000543190 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
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