RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 PASKQ96RG2 1323 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 CRY2Q49AN0 593 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 PSMD1Q99460 953 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 HACL1Q9UJ83 578 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 FZD9O00144 591 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 POTEIP0CG38 1075 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 POTEJP0CG39 1038 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 MIER1Q8N108 512 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 JDP2Q8WYK2 163 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 CNTNAP1P78357 1384 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 HLFQ16534 295 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 GPC2Q8N158 579 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 ERBB4Q15303 1308 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 FAM177BA6PVY3 158 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 EPHX2P34913 555 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 SYNE4Q8N205 404 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 SNED1Q8TER0 1413 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 NFE2L2Q16236 605 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-214ENST00000536509 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 OLFM4Q6UX06 510 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 NGEFQ8N5V2 710 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 SPOCK2Q92563 424 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 AIDAQ96BJ3 306 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 ABCC12Q96J65 1359 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 PARP10Q53GL7 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 CNTROBQ8N137 903 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 VPS33BQ9H267 617 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 MYL6BP14649 208 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 RASSF10A6NK89 507 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 VEGFBP49765 207 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 NLRP3Q96P20 1036 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 FOXN1O15353 648 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 GPTP24298 496 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 SUSD4Q5VX71 490 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 NTSR2O95665 410 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 NIM1KQ8IY84 436 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 WBP1LQ9NX94 342 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-214ENST00000536509 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 SCNN1DP51172 638 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 COL4A5P29400 1685 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 LTBP1Q14766 1721 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 LAMB2P55268 1798 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 PPIP5K2O43314 1243 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 BBOX1O75936 387 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 ECE1P42892 770 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-214ENST00000536509 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms