RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 PRELPP51888 382 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 SYNE4Q8N205 404 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 CNKSR1Q969H4 720 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 NFKBIEO00221 500 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 NPR1P16066 1061 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 RNF181Q9P0P0 153 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 LAMB2P55268 1798 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 CCER2I3L3R5 266 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 GOLGA2Q08379 1002 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 OLFM4Q6UX06 510 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF521Q96K83 1311 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 SLC51AQ86UW1 340 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-211ENST00000531385 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 CRY2Q49AN0 593 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 G2E3Q7L622 706 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 MYD88Q99836 296 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 STK31Q9BXU1 1019 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 MIER1Q8N108 512 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 VAMP4O75379 141 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 FAM89AQ96GI7 184 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 SLC4A2P04920 1241 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 LMNB1P20700 586 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 NLRP3Q96P20 1036 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 TAF1P21675 1872 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-211ENST00000531385 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 ALDH1B1P30837 517 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC93Q567U6 631 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 ABCC4O15439 1325 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 KSR2Q6VAB6 950 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 FLIIQ13045 1269 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 SOGA3Q5TF21 947 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 COL4A1P02462 1669 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 CACNA1FO60840 1977 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 SNED1Q8TER0 1413 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 IGKV5-2P06315 115 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-211ENST00000531385 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 KIF3CO14782 793 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC191Q8NCU4 936 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 E9PSI1 815 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 SLFN5Q08AF3 891 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 F6X3S4 739 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 C1QTNF8P60827 252 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 COL4A5P29400 1685 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 GRAPQ13588 217 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-211ENST00000531385 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRU-211ENST00000531385 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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