RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-211ENST00000529899 NYXQ9GZU5 481 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-211ENST00000529899 HYPKQ9NX55 129 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-211ENST00000529899 RNF181Q9P0P0 153 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-211ENST00000529899 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 NPR1P16066 1061 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 PARP10Q53GL7 1025 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 CNKSR1Q969H4 720 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 TAF1P21675 1872 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 CRY2Q49AN0 593 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 WDR63Q8IWG1 891 aa24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 G2E3Q7L622 706 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 COL4A1P02462 1669 aa24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF521Q96K83 1311 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 GOLGA2Q08379 1002 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 MYD88Q99836 296 aa24.18■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 LMNB1P20700 586 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 FAM89AQ96GI7 184 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 SNED1Q8TER0 1413 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 VAMP4O75379 141 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-211ENST00000529899 CCER2I3L3R5 266 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 KIF3CO14782 793 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC93Q567U6 631 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 NLRP3Q96P20 1036 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 STK31Q9BXU1 1019 aa24.14■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 ABCC4O15439 1325 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 SLC4A2P04920 1241 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 MIER1Q8N108 512 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 ALDH1B1P30837 517 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 CACNA1FO60840 1977 aa24.12■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 COL4A5P29400 1685 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 C1QTNF8P60827 252 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.11■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV5-2P06315 115 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 KSR2Q6VAB6 950 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.1■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 FLIIQ13045 1269 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 SOGA3Q5TF21 947 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TSTA3-211ENST00000529899 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 RRAGCQ9HB90 399 aa24.06■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 F6X3S4 739 aa24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.04■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 GLTPD2A6NH11 291 aa24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 SPEF2Q9C093 1822 aa24.03■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 MYH3P11055 1940 aa24.02■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.02■■□□□ 1.44
TSTA3-211ENST00000529899 SLFN5Q08AF3 891 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms