RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, human

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFTPC-211	ENST00000524318	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	PSMD1	Q99460	953 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SFTPC-211	ENST00000524318	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	FZD9	O00144	591 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	APAF1	O14727	1248 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HOXB7	P09629	217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	SCN4A	P35499	1836 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	GPC2	Q8N158	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	PCNT	O95613	3336 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	BBOX1	O75936	387 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	EPHX2	P34913	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ABCC4	O15439	1325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SFTPC-211	ENST00000524318	GNAI1	P63096	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	COL4A5	P29400	1685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	GRAP	Q13588	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	AOC3	Q16853	763 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	MPND	Q8N594	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFTPC-211	ENST00000524318	LAMB2	P55268	1798 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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