RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 NBPF15Q8N660 670 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 NARFQ9UHQ1 456 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 NCAPD2Q15021 1401 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 IFT57Q9NWB7 429 aa6.35□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 CCER2I3L3R5 266 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 CHL1O00533 1208 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 HLFQ16534 295 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 ST5P78524 1137 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 MYD88Q99836 296 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.34□□□□□ -1.39
CLVS1-205ENST00000519846 PTGER2P43116 358 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 RAD21O60216 631 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DPEP1P16444 411 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DDR1Q08345 913 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 H0YIN7 160 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.33□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 NHSQ6T4R5 1651 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 F6X3S4 739 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 SBF2Q86WG5 1849 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 YY1P25490 414 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 RETREG2Q8NC44 543 aa6.32□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PYGBP11216 843 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 G2E3Q7L622 706 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 FAM89AQ96GI7 184 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 ABCB7O75027 752 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CAMTA2O94983 1202 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 SYNE4Q8N205 404 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 HYPKQ9NX55 129 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 ITGB4P16144 1822 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CAPN15O75808 1086 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 WDR63Q8IWG1 891 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.31□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 E9PSI1 815 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PIM2Q9P1W9 311 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 G3V3G9 751 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 C21orf2O43822 256 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MAP2K5Q13163 448 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 ERFEQ4G0M1 354 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 IRF6O14896 467 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 NLRP3Q96P20 1036 aa6.3□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PDIA6Q15084 440 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 SUSD4Q5VX71 490 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PDE6BP35913 854 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 TTLL6Q8N841 843 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 POM121Q96HA1 1249 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 NYXQ9GZU5 481 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 PLIN1O60240 522 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 FBXW7Q969H0 707 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 BABAM1Q9NWV8 329 aa6.29□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 GRIN3BO60391 1043 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 C4BP0C0L5 1744 aa6.28□□□□□ -1.4
CLVS1-205ENST00000519846 MS4A1P11836 297 aa6.28□□□□□ -1.4
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