RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 NRAPQ86VF7 1730 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 PLIN1O60240 522 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 CHL1O00533 1208 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 COL18A1P39060 1754 aa8.3□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 CCER2I3L3R5 266 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 C21orf2O43822 256 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 RASEFQ8IZ41 740 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRP3Q96P20 1036 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 PIM2Q9P1W9 311 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNE4Q8N205 404 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 HYPKQ9NX55 129 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 DDR1Q08345 913 aa8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC37A3O60309 1634 aa8.27□□□□□ -1.08
RRN3P1-201ENST00000514813 E9PSI1 815 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 G2E3Q7L622 706 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PTGER2P43116 358 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 MFRPQ9BY79 579 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 C6orf229H3BNL8 230 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.27□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE6BP35913 854 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 ERFEQ4G0M1 354 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 TTLL6Q8N841 843 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC6O95255 1503 aa8.26□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNJ4P48050 445 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 IRF5Q13568 498 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR63Q8IWG1 891 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF181Q9P0P0 153 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 GRIN3BO60391 1043 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CAMTA2O94983 1202 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 SUSD4Q5VX71 490 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 NYXQ9GZU5 481 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 POM121Q96HA1 1249 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.25□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 RIMBP2O15034 1052 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 OLFM4Q6UX06 510 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 NCAPD2Q15021 1401 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 GRM1Q13255 1194 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 TCIRG1Q13488 830 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 JDP2Q8WYK2 163 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.23□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CNKSR1Q969H4 720 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 VAMP4O75379 141 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 BCAR3O75815 825 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 BTAF1O14981 1849 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 RASSF7Q02833 373 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 PARP10Q53GL7 1025 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 KSR2Q6VAB6 950 aa8.22□□□□□ -1.09
RRN3P1-201ENST00000514813 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.22□□□□□ -1.09
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