RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF5Q96JK2 942 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA32Q96LK8 384 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3C2AO00443 1686 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGGTB-213ENST00000496055 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.59□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 FOSBP53539 338 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 NHSQ6T4R5 1651 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA6P17066 643 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ4P48050 445 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 EFCC1Q9HA90 598 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP10P09238 476 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP53Q96M91 514 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PIM2Q9P1W9 311 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 COQ9O75208 318 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 ATP10DQ9P241 1426 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 UVSSAQ2YD98 709 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF853P0CG23 659 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TESK2Q96S53 571 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF16BQ96L93 1317 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 STARD3NLO95772 234 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PHKG2P15735 406 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS6KA4O75676 772 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD62A6NC57 917 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 UNCXA6NJT0 531 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ESPNB1AK53 854 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TOMM70O94826 608 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 COL18A1P39060 1754 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TEFQ10587 303 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGGTB-213ENST00000496055 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOM1P52179 1685 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP27B1O15528 508 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PAX7P23759 505 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SOGA3Q5TF21 947 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 EYA1Q99502 592 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF3Q9H094 633 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB11FIP3O75154 756 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 NAT1P18440 290 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MEGF6O75095 1541 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FSTL1Q12841 308 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 IRF5Q13568 498 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 IFFO2Q5TF58 517 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 H0YIN7 160 aa5.54□□□□□ -1.52
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