RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 WBP1LQ9NX94 342 aa30.66■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.65■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 THSD7BQ9C0I4 1608 aa30.64■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.64■■■□□ 2.5
SIMC1-208ENST00000495423 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.63■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 GRIPAP1Q4V328 841 aa30.62■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.61■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.59■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.59■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.59■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 NGEFQ8N5V2 710 aa30.59■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SIMC1-208ENST00000495423 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.57■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.57■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 LBX1P52954 281 aa30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 LAMB2P55268 1798 aa30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.56■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 GPTP24298 496 aa30.55■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 SCNN1DP51172 638 aa30.55■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.55■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 NEFMP07197 916 aa30.54■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 SUSD4Q5VX71 490 aa30.54■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.54■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 ERBB4Q15303 1308 aa30.53■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 NTSR2O95665 410 aa30.53■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.53■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 MYL6BP14649 208 aa30.52■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.52■■■□□ 2.48
SIMC1-208ENST00000495423 EPS15P42566 896 aa30.51■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 NFE2L2Q16236 605 aa30.5■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 SLC51AQ86UW1 340 aa30.5■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 PARP10Q53GL7 1025 aa30.48■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 C3orf67Q6ZVT6 689 aa30.48■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa30.48■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 NIM1KQ8IY84 436 aa30.48■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 VPS33BQ9H267 617 aa30.48■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 ECE1P42892 770 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 SLC10A5Q5PT55 438 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 LRP10Q7Z4F1 713 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 CAPNS2Q96L46 248 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 NLRP3Q96P20 1036 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa30.45■■■□□ 2.47
SIMC1-208ENST00000495423 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 PPIP5K2O43314 1243 aa30.44■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 CST9Q5W186 159 aa30.44■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 TAF1P21675 1872 aa30.43■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 ABHD8Q96I13 439 aa30.43■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.43■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 PDIA6Q15084 440 aa30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 AOC3Q16853 763 aa30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.42■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 TRAF5O00463 557 aa30.41■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 ABCC4O15439 1325 aa30.41■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.4■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.4■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.4■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 CXCL9Q07325 125 aa30.39■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.39■■■□□ 2.46
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.39■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.38■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.37■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.37■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 BBOX1O75936 387 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 MAP2K2P36507 400 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 SP8Q8IXZ3 490 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.35■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 PROSER3Q2NL68 480 aa30.34■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.33■■■□□ 2.45
SIMC1-208ENST00000495423 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms