RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KAT14Q9H8E8 782 aa19.79■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 HOXC9P31274 260 aa19.79■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 MCM5P33992 734 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 TMTC2Q8N394 836 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 CFAP100Q494V2 611 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 IQCEQ6IPM2 695 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 KRT23Q9C075 422 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 PPP4R3AQ6IN85 833 aa19.78■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 SYCE3A1L190 88 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 PDE1AP54750 535 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
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NISCH-213ENST00000489895 PBRM1Q86U86 1689 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 DNAI2Q9GZS0 605 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 CNNM2Q9H8M5 875 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-213ENST00000489895 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.77■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.77■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.77■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TRAF1Q13077 416 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 MYO1BO43795 1136 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 STX6O43752 255 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 POTEJP0CG39 1038 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.75■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 GJB2P29033 226 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 C8orf37Q96NL8 207 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.75■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 PAF1Q8N7H5 531 aa19.75■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 ERLIN1O75477 346 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 AMPD3Q01432 767 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 FEZ1Q99689 392 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 CNNM3Q8NE01 707 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 NEO1Q92859 1461 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ESR2Q92731 530 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 CYP7A1P22680 504 aa19.72■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 KANK3Q6NY19 840 aa19.72■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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NISCH-213ENST00000489895 CALML4Q96GE6 196 aa19.72■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ESPNB1AK53 854 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ZNF804AQ7Z570 1209 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 MICU3Q86XE3 530 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 HDAC9Q9UKV0 1011 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 CEP170Q5SW79 1584 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1328Q86T90 577 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 GNAQP50148 359 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 HOXB7P09629 217 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L10A6NI86 522 aa19.71■□□□□ 0.74
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