RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ALDH1B1P30837 517 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 APLP1P51693 650 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FSTL1Q12841 308 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PARP10Q53GL7 1025 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OLFM4Q6UX06 510 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COPS6Q7L5N1 327 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFAP44Q96MT7 982 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 APAF1O14727 1248 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HOXB7P09629 217 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNED1Q8TER0 1413 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZBTB22O15209 634 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MBIPQ9NS73 344 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POTECB2RU33 542 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF853P0CG23 659 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLRP10Q86W26 655 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IFT57Q9NWB7 429 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TCIRG1Q13488 830 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC184Q52MB2 194 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLRP3Q96P20 1036 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMB2P55268 1798 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GNAI1P63096 354 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYNE4Q8N205 404 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSMD1Q99460 953 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC51AQ86UW1 340 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PCNTO95613 3336 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HTRA3P83110 453 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HYPKQ9NX55 129 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCC4O15439 1325 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCN4AP35499 1836 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COL4A5P29400 1685 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FZD9O00144 591 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF428Q96B54 188 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POTEIP0CG38 1075 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POTEJP0CG39 1038 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 JDP2Q8WYK2 163 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KLRG1Q96E93 195 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANP32CO43423 234 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GOLGA2Q08379 1002 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC27Q2M243 656 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHADLQ6NUI6 762 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRS2Q9HD23 443 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TAF1P21675 1872 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BBOX1O75936 387 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRAPQ13588 217 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPC2Q8N158 579 aa23.56■■□□□ 1.36
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