RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ALDH1B1P30837 517 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NYXQ9GZU5 481 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MBIPQ9NS73 344 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR90Q96KV7 1748 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF853P0CG23 659 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NLRP10Q86W26 655 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ERBB4Q15303 1308 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TCIRG1Q13488 830 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SOGA3Q5TF21 947 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RTKN2Q8IZC4 609 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C8orf58Q8NAV2 365 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KLRG1Q96E93 195 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CFAP44Q96MT7 982 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FZD9O00144 591 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TAF1P21675 1872 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL4A1P02462 1669 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PARP10Q53GL7 1025 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHADLQ6NUI6 762 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPYL6Q8N831 410 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM89AQ96GI7 184 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NLRP3Q96P20 1036 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCC4O15439 1325 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 JMYQ8N9B5 988 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSMD1Q99460 953 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PCNTO95613 3336 aa9.96□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPS15P42566 896 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AOC3Q16853 763 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IFFO2Q5TF58 517 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LTBP1Q14766 1721 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LAMB2P55268 1798 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPHX2P34913 555 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IFT57Q9NWB7 429 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HACL1Q9UJ83 578 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PASKQ96RG2 1323 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SHTN1A0MZ66 631 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HOXB7P09629 217 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCNN1DP51172 638 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SP8Q8IXZ3 490 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPC2Q8N158 579 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 JDP2Q8WYK2 163 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HYPKQ9NX55 129 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPIP5K2O43314 1243 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BBOX1O75936 387 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GNAI1P63096 354 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CXCL9Q07325 125 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-220ENST00000454996 G2E3Q7L622 706 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms