RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 NFE2L2Q16236 605 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 FOXN1O15353 648 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 MYL6BP14649 208 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 GPTP24298 496 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 VEGFBP49765 207 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 SUSD4Q5VX71 490 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 JDP2Q8WYK2 163 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 CNTROBQ8N137 903 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 ERBB4Q15303 1308 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 NTSR2O95665 410 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 SLC51AQ86UW1 340 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-209ENST00000451506 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 LTBP1Q14766 1721 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 RASSF10A6NK89 507 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 WBP1LQ9NX94 342 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 SCNN1DP51172 638 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PDIA6Q15084 440 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PARP10Q53GL7 1025 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 AIDAQ96BJ3 306 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 EPS15P42566 896 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-209ENST00000451506 NLRP3Q96P20 1036 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 PROSER3Q2NL68 480 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 NIM1KQ8IY84 436 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 PPIP5K2O43314 1243 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 ANXA1P04083 346 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 LBX1P52954 281 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 VPS33BQ9H267 617 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 RIPK4P57078 832 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 AOC3Q16853 763 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 ABCC4O15439 1325 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRN-209ENST00000451506 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 CST9Q5W186 159 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 NLRP10Q86W26 655 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TRAF5O00463 557 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 BBOX1O75936 387 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 CXCL9Q07325 125 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 COPS6Q7L5N1 327 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 SP8Q8IXZ3 490 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 CAPNS2Q96L46 248 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 LAMB2P55268 1798 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 NECTIN2Q92692 538 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 ECE1P42892 770 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TCIRG1Q13488 830 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 MPNDQ8N594 471 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRN-209ENST00000451506 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.39■■□□□ 1.17
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