RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 SRGNP10124 158 aa23.07■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 STYK1Q6J9G0 422 aa23.07■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.07■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.06■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.06■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 MASTLQ96GX5 879 aa23.06■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 NPR1P16066 1061 aa23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 FLIIQ13045 1269 aa23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 KSR2Q6VAB6 950 aa23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 CNKSR1Q969H4 720 aa23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.04■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.04■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 G2E3Q7L622 706 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 MYD88Q99836 296 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.03■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 CRY2Q49AN0 593 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.02■■□□□ 1.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF428Q96B54 188 aa23.02■■□□□ 1.28
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SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 CACNA1FO60840 1977 aa23.01■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP3Q96P20 1036 aa23■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 ALDH1B1P30837 517 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 SOGA3Q5TF21 947 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 SYNE4Q8N205 404 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM89AQ96GI7 184 aa22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SEMA3B-201ENST00000416295 C21orf2O43822 256 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.95■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 IGKV5-2P06315 115 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.94■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 LINS1Q8NG48 757 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 SLX4Q8IY92 1834 aa22.92■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 PTPRCP08575 1304 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 F6X3S4 739 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC93Q567U6 631 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.89■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SEMA3B-201ENST00000416295 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 CACNA1SQ13698 1873 aa22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 LAMB2P55268 1798 aa22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 NFKBIEO00221 500 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 RASSF7Q02833 373 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 GCKRQ14397 625 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.88■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.87■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 LMNB1P20700 586 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 BEND3Q5T5X7 828 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 BBOX1O75936 387 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 RNF181Q9P0P0 153 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 GRAPQ13588 217 aa22.85■■□□□ 1.25
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.85■■□□□ 1.25
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