RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 MS4A1P11836 297 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF853P0CG23 659 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 SRGNP10124 158 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 GNAI1P63096 354 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 STYK1Q6J9G0 422 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 CNKSR1Q969H4 720 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 CAPNS2Q96L46 248 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRC-206ENST00000413409 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 CFAP44Q96MT7 982 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 KIF16BQ96L93 1317 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 CACNA1SQ13698 1873 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 SOGA3Q5TF21 947 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 GRM1Q13255 1194 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 OLFM4Q6UX06 510 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 PANK1Q8TE04 598 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 MASTLQ96GX5 879 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 MRC1P22897 1456 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 A0A087WZG4 1122 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 AOC2O75106 756 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 COG6Q9Y2V7 657 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 LTBP1Q14766 1721 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRC-206ENST00000413409 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC93Q567U6 631 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 CST9Q5W186 159 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 CNBD1Q8NA66 436 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 FZD9O00144 591 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 ECE1P42892 770 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 SCN7AQ01118 1682 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 RLBP1P12271 317 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRC-206ENST00000413409 STARD3NLO95772 234 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 SETDB2Q96T68 719 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 MBIPQ9NS73 344 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 GPC2Q8N158 579 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 CAMTA2O94983 1202 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 MAP2K2P36507 400 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 ST5P78524 1137 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 DGKZQ13574 1117 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRC-206ENST00000413409 TRIM27P14373 513 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 TNNQ9UQP3 1299 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 NPHP1O15259 732 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 VAMP4O75379 141 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 SYNE4Q8N205 404 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 NPR1P16066 1061 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 EPS15P42566 896 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 COL4A5P29400 1685 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 CHL1O00533 1208 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 A1BGP04217 495 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 SCNN1DP51172 638 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 CA12O43570 354 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRC-206ENST00000413409 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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