RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-203ENST00000395564 FAM177BA6PVY3 158 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ALDH1L1O75891 902 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 TGFB2P61812 414 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 TRIM27P14373 513 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 PDE6BP35913 854 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ERFEQ4G0M1 354 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 KLHL34Q8N239 644 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SYT17Q9BSW7 474 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 GCKRQ14397 625 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ABCC4O15439 1325 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 ABCC12Q96J65 1359 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-203ENST00000395564 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 FAM89AQ96GI7 184 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 H7C1W4 665 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 MS4A1P11836 297 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 NLRP3Q96P20 1036 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 H0YIN7 160 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 GRM8O00222 908 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 SYNE4Q8N205 404 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 LAMB2P55268 1798 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 CRY2Q49AN0 593 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 UTYO14607 1347 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 DPEP1P16444 411 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 CASP7P55210 303 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-203ENST00000395564 A0A0G2JLW4 131 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 PDE8AO60658 829 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 SRGNP10124 158 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 NPR1P16066 1061 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 KCNA3P22001 575 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 CHRNA5P30532 468 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 MASTLQ96GX5 879 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 TNNQ9UQP3 1299 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 STYK1Q6J9G0 422 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 USP44Q9H0E7 712 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 PIM2Q9P1W9 311 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 PDE3AQ14432 1141 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 ALDH1B1P30837 517 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 CNKSR1Q969H4 720 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 PLIN1O60240 522 aa22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 RLBP1P12271 317 aa22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 CTSWP56202 376 aa22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 TTLL6Q8N841 843 aa22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.64■■□□□ 1.22
UPP1-203ENST00000395564 MYH3P11055 1940 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-203ENST00000395564 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms