RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370408.2

ERLIN1-201, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene ERLIN1, Length 962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-201ENST00000370408 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.41■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.41■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 SYNE4Q8N205 404 aa28.4■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 CACNA1SQ13698 1873 aa28.4■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.39■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 CFAP44Q96MT7 982 aa28.39■■■□□ 2.14
ERLIN1-201ENST00000370408 APAF1O14727 1248 aa28.38■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.37■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 WDR90Q96KV7 1748 aa28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 TCIRG1Q13488 830 aa28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 NLRP3Q96P20 1036 aa28.36■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 NLRP10Q86W26 655 aa28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 MBIPQ9NS73 344 aa28.35■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 HOXB7P09629 217 aa28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 SLC51AQ86UW1 340 aa28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 PSMD1Q99460 953 aa28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 SNED1Q8TER0 1413 aa28.34■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF853P0CG23 659 aa28.33■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.33■■■□□ 2.13
ERLIN1-201ENST00000370408 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 POTEIP0CG38 1075 aa28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 POTEJP0CG39 1038 aa28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 KLRG1Q96E93 195 aa28.31■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 FZD9O00144 591 aa28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC184Q52MB2 194 aa28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF428Q96B54 188 aa28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 IFT57Q9NWB7 429 aa28.29■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.28■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.28■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 CHADLQ6NUI6 762 aa28.28■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 GNAI1P63096 354 aa28.27■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 JDP2Q8WYK2 163 aa28.27■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 HYPKQ9NX55 129 aa28.27■■■□□ 2.12
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCC4O15439 1325 aa28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.25■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.25■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 JMYQ8N9B5 988 aa28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 HACL1Q9UJ83 578 aa28.23■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 BBOX1O75936 387 aa28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 GPC2Q8N158 579 aa28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 LDHDQ86WU2 507 aa28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 COL4A5P29400 1685 aa28.21■■■□□ 2.11
ERLIN1-201ENST00000370408 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 SP8Q8IXZ3 490 aa28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 FAM89AQ96GI7 184 aa28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.2■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 EPHX2P34913 555 aa28.19■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 PPIP5K2O43314 1243 aa28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 GRAPQ13588 217 aa28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 AOC3Q16853 763 aa28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 NIM1KQ8IY84 436 aa28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.16■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 MPNDQ8N594 471 aa28.16■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 VPS33BQ9H267 617 aa28.16■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.16■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 GOLGA2Q08379 1002 aa28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.15■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 IFFO2Q5TF58 517 aa28.14■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 TSPYL6Q8N831 410 aa28.14■■■□□ 2.1
ERLIN1-201ENST00000370408 SCN4AP35499 1836 aa28.13■■■□□ 2.09
ERLIN1-201ENST00000370408 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms