RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CLTB-202ENST00000345807 SYNE4Q8N205 404 aa29.7■■■□□ 2.35
CLTB-202ENST00000345807 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 KRT24Q2M2I5 525 aa29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 COPS6Q7L5N1 327 aa29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 SNED1Q8TER0 1413 aa29.68■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 PSMD1Q99460 953 aa29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.67■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.66■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 IFFO2Q5TF58 517 aa29.66■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.66■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.66■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 CHADLQ6NUI6 762 aa29.65■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 JMYQ8N9B5 988 aa29.65■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 NLRP3Q96P20 1036 aa29.65■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
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CLTB-202ENST00000345807 POTEJP0CG39 1038 aa29.64■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.64■■■□□ 2.34
CLTB-202ENST00000345807 SCN4AP35499 1836 aa29.64■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.63■■■□□ 2.33
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CLTB-202ENST00000345807 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.63■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 FZD9O00144 591 aa29.62■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.62■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 NLRP10Q86W26 655 aa29.61■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 JDP2Q8WYK2 163 aa29.61■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 CHPF2Q9P2E5 772 aa29.61■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.61■■■□□ 2.33
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CLTB-202ENST00000345807 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa29.6■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 HOXB7P09629 217 aa29.59■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 SLC51AQ86UW1 340 aa29.59■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 CFAP44Q96MT7 982 aa29.59■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 LDHDQ86WU2 507 aa29.58■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 HACL1Q9UJ83 578 aa29.58■■■□□ 2.33
CLTB-202ENST00000345807 GPC2Q8N158 579 aa29.56■■■□□ 2.32
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CLTB-202ENST00000345807 COL4A5P29400 1685 aa29.56■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 ABCC4O15439 1325 aa29.55■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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CLTB-202ENST00000345807 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.55■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 MBIPQ9NS73 344 aa29.55■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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CLTB-202ENST00000345807 APAF1O14727 1248 aa29.54■■■□□ 2.32
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CLTB-202ENST00000345807 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.52■■■□□ 2.32
CLTB-202ENST00000345807 ZNF853P0CG23 659 aa29.51■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 HYPKQ9NX55 129 aa29.51■■■□□ 2.31
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CLTB-202ENST00000345807 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
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CLTB-202ENST00000345807 IFT57Q9NWB7 429 aa29.5■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 PASKQ96RG2 1323 aa29.49■■■□□ 2.31
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CLTB-202ENST00000345807 GNAI1P63096 354 aa29.48■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 NIM1KQ8IY84 436 aa29.48■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.48■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 AOC3Q16853 763 aa29.47■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 SP8Q8IXZ3 490 aa29.47■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 VPS33BQ9H267 617 aa29.47■■■□□ 2.31
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CLTB-202ENST00000345807 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CLTB-202ENST00000345807 MPNDQ8N594 471 aa29.44■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 LTBP1Q14766 1721 aa29.43■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 PCNTO95613 3336 aa29.43■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 FAM89AQ96GI7 184 aa29.43■■■□□ 2.3
CLTB-202ENST00000345807 SCNN1DP51172 638 aa29.42■■■□□ 2.3
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