RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.53■□□□□ 0.88
IFT20-201ENST00000322326 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.52■□□□□ 0.88
IFT20-201ENST00000322326 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.51■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.51■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 SCN4AP35499 1836 aa20.5■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 POTEIP0CG38 1075 aa20.5■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 POTEJP0CG39 1038 aa20.5■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 LDHDQ86WU2 507 aa20.49■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.48■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 NBPF26B4DH59 902 aa20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 ALDH1B1P30837 517 aa20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 NBPF15Q8N660 670 aa20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 FAM177BA6PVY3 158 aa20.46■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
IFT20-201ENST00000322326 PASKQ96RG2 1323 aa20.45■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 HACL1Q9UJ83 578 aa20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 CNTNAP1P78357 1384 aa20.44■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 HLFQ16534 295 aa20.43■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 NYXQ9GZU5 481 aa20.43■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 OLFM4Q6UX06 510 aa20.42■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 SYNE4Q8N205 404 aa20.42■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.42■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.42■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 HOXB7P09629 217 aa20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 EPHX2P34913 555 aa20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 ZNF428Q96B54 188 aa20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.41■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 FZD9O00144 591 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 KRT24Q2M2I5 525 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 JDP2Q8WYK2 163 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.4■□□□□ 0.86
IFT20-201ENST00000322326 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.39■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 TSPYL6Q8N831 410 aa20.39■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 PSMD1Q99460 953 aa20.39■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 NUP98P52948 1817 aa20.39■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 VAMP4O75379 141 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 CRY2Q49AN0 593 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 GPC2Q8N158 579 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 AIDAQ96BJ3 306 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.38■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 ABCC12Q96J65 1359 aa20.37■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 FOXN1O15353 648 aa20.37■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.37■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 VEGFBP49765 207 aa20.36■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.36■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 CNTROBQ8N137 903 aa20.36■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.36■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.35■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.35■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 SNED1Q8TER0 1413 aa20.35■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 MYL6BP14649 208 aa20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 GPTP24298 496 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.33■□□□□ 0.85
IFT20-201ENST00000322326 CACNA1FO60840 1977 aa20.33■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.32■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.32■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 STK31Q9BXU1 1019 aa20.32■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 ERBB4Q15303 1308 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 RASSF10A6NK89 507 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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