RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM27P14373 513 aa16.8■□□□□ 0.28
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CCDC42-201ENST00000293845 CNBD1Q8NA66 436 aa16.8■□□□□ 0.28
CCDC42-201ENST00000293845 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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CCDC42-201ENST00000293845 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
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CCDC42-201ENST00000293845 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.78■□□□□ 0.28
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CCDC42-201ENST00000293845 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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CCDC42-201ENST00000293845 PDE3AQ14432 1141 aa16.71■□□□□ 0.27
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CCDC42-201ENST00000293845 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.69■□□□□ 0.26
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CCDC42-201ENST00000293845 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.68■□□□□ 0.26
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CCDC42-201ENST00000293845 TAF1P21675 1872 aa16.67■□□□□ 0.26
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CCDC42-201ENST00000293845 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MASTLQ96GX5 879 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 MEIS3Q99687 375 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 RTL9Q8NET4 1388 aa16.66■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0G2JLW4 131 aa16.65■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 NPR1P16066 1061 aa16.65■□□□□ 0.26
CCDC42-201ENST00000293845 CTSWP56202 376 aa16.65■□□□□ 0.26
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