RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 CEP85Q6P2H3 762 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 DDX11Q96FC9 970 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 GRM8O00222 908 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ANAPC15P60006 121 aa20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 DDB1Q16531 1140 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TAF3Q5VWG9 929 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF790Q6PG37 636 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 USP6P35125 1406 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.05■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF165P49910 485 aa20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 SNRKQ9NRH2 765 aa20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 KIF18AQ8NI77 898 aa20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 OLFM4Q6UX06 510 aa20.04■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ATP8B2P98198 1209 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 LINS1Q8NG48 757 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 ABCF2Q9UG63 623 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 MADDQ8WXG6 1647 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CCP110O43303 1012 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 IGSF3O75054 1194 aa20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.02■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 PKP1Q13835 747 aa20.02■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 UBXN4Q92575 508 aa20.02■□□□□ 0.8
TRPC1-201ENST00000273482 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.02■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ERICH2A1L162 156 aa20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 SERPINC1P01008 464 aa20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ATP7BP35670 1465 aa20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRB3O60242 1522 aa20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ALKQ9UM73 1620 aa20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ERBB4Q15303 1308 aa20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ZPR1O75312 459 aa20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 FAM200AQ8TCP9 573 aa20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 GLI2P10070 1586 aa20■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA6Q8N139 1617 aa19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ALDH1L1O75891 902 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V1AP38606 617 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 F13A1P00488 732 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 A1BGP04217 495 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 NECAB1Q8N987 351 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 MYRIPQ8NFW9 859 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 LRP2BPQ9P2M1 347 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 KRT32Q14532 448 aa19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 TSC1Q92574 1164 aa19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF10O15013 1369 aa19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 GOLIM4O00461 696 aa19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 ANO10Q9NW15 660 aa19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.96■□□□□ 0.79
TRPC1-201ENST00000273482 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms