RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa27.39■■□□□ 1.98
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chrna5Q2MKA5 467 aa27.38■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fbxo33Q8VE08 562 aa27.38■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Glt1d1A4FUP9 346 aa27.37■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif6O55135 245 aa27.35■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa27.35■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cnksr1A2A9K7 700 aa27.34■■□□□ 1.97
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nkx1-1G3UXB3 402 aa27.33■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 VegfbP49766 207 aa27.33■■□□□ 1.97
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Micall1Q8BGT6 870 aa27.32■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Foxo4Q9WVH3 505 aa27.32■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NynrinQ5DTZ0 1840 aa27.32■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Isca1Q9D924 129 aa27.31■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GptQ8QZR5 496 aa27.3■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atxn3Q9CVD2 355 aa27.3■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plagl1Q9JLQ4 704 aa27.29■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 EvplQ9D952 2035 aa27.29■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MypnQ5DTJ9 1315 aa27.28■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Vsig10D3YX43 558 aa27.27■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cops6O88545 324 aa27.27■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Magea8O89012 320 aa27.27■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cyp7a1Q64505 503 aa27.27■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ly6iQ9WU67 134 aa27.27■■□□□ 1.96
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eddm13E9Q7F5 164 aa27.26■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CoilQ5SU73 570 aa27.26■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dpp7Q9ET22 506 aa27.26■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kank1E9Q238 1360 aa27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 WasP70315 520 aa27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Psmd1Q3TXS7 953 aa27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 EappQ5BU09 281 aa27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ecm29Q6PDI5 1840 aa27.25■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Oas2E9Q9A9 742 aa27.24■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adarb2Q9JI20 745 aa27.24■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Greb1lB9EJV3 1913 aa27.24■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NfixP70257 488 aa27.23■■□□□ 1.95
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc93Q7TQK5 629 aa27.23■■□□□ 1.95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dydc2Q9D3X8 139 aa27.23■■□□□ 1.95
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddx58Q6Q899 926 aa27.2■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Skor1Q8BX46 964 aa27.2■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc51aQ8R000 340 aa27.2■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Usp34Q6ZQ93 3582 aa27.19■■□□□ 1.94
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Clca2Q8BG22 942 aa27.19■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tnip1Q9WUU8 647 aa27.19■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gdf11Q9Z1W4 405 aa27.19■■□□□ 1.94
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cwc25Q9DBF7 416 aa27.18■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd50F7BE84 1390 aa27.18■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col1a1P11087 1453 aa27.18■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neurod2Q62414 383 aa27.17■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Best3Q6H1V1 669 aa27.17■■□□□ 1.94
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CrbnQ8C7D2 445 aa27.16■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Angel2Q8K1C0 544 aa27.16■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Echdc1Q9D9V3 322 aa27.16■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stard3nlQ9DCI3 235 aa27.16■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Aplp1Q03157 653 aa27.15■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Glis3Q6XP49 780 aa27.15■■□□□ 1.94
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa27.15■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mrs2Q5NCE8 434 aa27.14■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Scaf8Q6DID3 1268 aa27.14■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif2cQ922S8 721 aa27.14■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ehd4Q9EQP2 541 aa27.14■■□□□ 1.94
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k15A2AQW0 1331 aa27.14■■□□□ 1.93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myo3bQ1EG27 1305 aa27.14■■□□□ 1.93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam213aQ9CYH2 218 aa27.13■■□□□ 1.93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GmpsQ3THK7 693 aa27.12■■□□□ 1.93
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