RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sgsm2Q80U12 1005 aa18.04■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm12185Q5NCB2 835 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atg9aQ68FE2 551 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmx3Q8BXZ1 456 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smim5Q8BT42 78 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ImpactO55091 318 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb45Q52KG4 520 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx11Q6AXC6 880 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rufy3Q9D394 469 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cwc25Q9DBF7 416 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fer1l6E0CZ42 1862 aa18.03■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gjb2Q00977 226 aa18.02■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bmp2kQ91Z96 1138 aa18.02■□□□□ 0.48
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa18.02■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrp5Q91VN0 1614 aa18.02■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl3d2F6R3P9 224 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ZyxQ62523 564 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmc2Q8R4P4 888 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sult6b1P0CC03 303 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NfkbibQ60778 359 aa18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fbxl16A2RT62 479 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tti2Q8BGV4 512 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sp8Q8BMJ8 486 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cap2Q9CYT6 476 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ak2Q9WTP6 239 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 St18Q80TY4 1045 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dhx38Q80X98 1228 aa18■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stard3nlQ9DCI3 235 aa17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ciao1Q99KN2 339 aa17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zeb2Q9R0G7 1215 aa17.99■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssc5dQ8BV57 1371 aa17.98■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam213aQ9CYH2 218 aa17.98■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spryd3E9Q9B3 442 aa17.98■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myd88P22366 296 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Jarid2Q62315 1234 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MetP16056 1379 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il4rP16382 810 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mdm2P23804 489 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf526Q8BI66 675 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8C5K5 320 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cchcr1Q8K2I2 770 aa17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syt1P46096 421 aa17.96■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa17.96■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa17.96■□□□□ 0.47
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ugt1a5B2RT14 529 aa17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gripap1Q8VD04 806 aa17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdca7lQ922M5 438 aa17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nwd2Q6P5U7 1742 aa17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LratQ9JI60 231 aa17.94■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eya2O08575 532 aa17.94■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atf7Q8R0S1 413 aa17.94■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nek11Q8C0Q4 628 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hmg20bQ9Z104 317 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sik1Q60670 779 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ApobrQ8VBT6 942 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lama4P97927 1816 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh7Q91Z83 1935 aa17.93■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9992B2RWK3 458 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mctp2Q5RJH2 878 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Unc93aQ710D3 458 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clca2Q8BG22 942 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ginm1Q91WR6 327 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9D9S1 216 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smc4Q8CG47 1286 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh1Q5SX40 1942 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Neurod6P48986 337 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clcn1Q64347 994 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Asap2Q7SIG6 958 aa17.92■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp19a1P28649 503 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps54Q5SPW0 977 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mb21d2Q8C525 428 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pof1bQ8K4L4 587 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Phf14Q9D4H9 881 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dcaf5Q80T85 946 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gimap5Q8BWF2 308 aa17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eef2kO08796 724 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms