RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056749.13

Nhlrc3-201, Transcript of NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlrc3, Length 5,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tmem266Q8BZB3 538 aa13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc172Q810N9 267 aa13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tango6Q8C3S2 1079 aa13.16□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Palm3A2TJV2 734 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AU019823E9PUQ3 292 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ano8Q6PB70 1060 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Q4VA45 678 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dusp9Q7TNL7 452 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cep57l1Q8VDS7 400 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lmbr1Q9JIT0 490 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pof1bQ8K4L4 587 aa13.15□□□□□ -0.3
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tmem2Q5FWI3 1383 aa13.15□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cnksr1A2A9K7 700 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cep55Q8BT07 462 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NmiO35309 314 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Drc7Q6V3W6 876 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rufy2Q8R4C2 606 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Aldh8a1Q8BH00 487 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fez1Q8K0X8 392 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olr1Q9EQ09 363 aa13.14□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ces1hD3Z298 562 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cops6O88545 324 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zbtb3Q91X45 518 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Iqgap3F8VQ29 1632 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kdm4aQ8BW72 1064 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cdan1Q8CC12 1239 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Erbb3Q61526 1339 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Usp19Q3UJD6 1360 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nkx1-2P42580 305 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cnnm3Q32NY4 713 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam160b2Q80YR2 744 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lrrc45Q8CIM1 670 aa13.13□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prex1Q69ZK0 1650 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Irx3P81067 507 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tshz3Q8CGV9 1081 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 P2rx7Q9Z1M0 595 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 TnrQ8BYI9 1358 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 IncenpQ9WU62 880 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Traf3ip1Q149C2 625 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pdcl3Q8BVF2 240 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PdcQ9QW08 244 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Abca9Q8K449 1623 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PtpruB1AUH1 1446 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gcom1E9PZ54 550 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 MyzapQ3UIJ9 466 aa13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nphp3Q7TNH6 1325 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ttc14Q9CSP9 761 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Akap12Q9WTQ5 1684 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nap1l2P51860 460 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Samm50Q8BGH2 469 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Brinp3Q499E0 766 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Xrcc4Q924T3 326 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Letm1Q9Z2I0 738 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prdm11A2AGX3 565 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Morc2aQ69ZX6 1030 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa13.11□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Adamts13Q769J6 1426 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AcrbpQ3V140 540 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Foxo3Q9WVH4 672 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 SelenooQ9DBC0 667 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Eif5P59325 429 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ankrd23Q812A3 306 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AceP09470 1312 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 IntuQ059U7 942 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hand2Q61039 217 aa13.1□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Stk36Q69ZM6 1316 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mmp8O70138 465 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Atg3Q9CPX6 314 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Iqca1Q9CUL5 857 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prm3Q62100 101 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 LratQ9JI60 231 aa13.09□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Stx8O88983 236 aa13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Erich4Q3UNU4 136 aa13.08□□□□□ -0.31
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dcaf5Q80T85 946 aa13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms