RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nav1Q8CH77 1875 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zkscan2G3X952 960 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp9bQ66X22 1003 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mum1Q6DID5 682 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klc3Q91W40 508 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erbb4Q61527 1308 aa15.28■□□□□ 0.04
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna1sQ02789 1880 aa15.28■□□□□ 0.04
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syce3B5KM66 88 aa15.27■□□□□ 0.03
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GptQ8QZR5 496 aa15.27■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chmp3Q9CQ10 224 aa15.27■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cwc25Q9DBF7 416 aa15.27■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard3nlQ9DCI3 235 aa15.27■□□□□ 0.03
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zkscan16A2ALW2 728 aa15.26■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pank2Q3U4S0 443 aa15.26■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InsrrQ9WTL4 1300 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AK157302I3ITR1 129 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EspnlQ3UYR4 1005 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnat3Q3V3I2 354 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mylk2Q8VCR8 613 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isca1Q9D924 129 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GakQ99KY4 1305 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brpf1B2RRD7 1212 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a8Q8R0C3 999 aa15.25■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ImpactO55091 318 aa15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phactr2B1AVP0 632 aa15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cct4P80315 539 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VgfQ0VGU4 617 aa15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpa2Q504N0 417 aa15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcc4E9Q236 1325 aa15.24■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp6O88572 1613 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erc2Q6PH08 957 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brf1Q8CFK2 676 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emilin2Q8K482 1074 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam84aQ9D650 292 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripk4Q9ERK0 786 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc5clQ6R653 518 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tshz3Q8CGV9 1081 aa15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sos2Q02384 1333 aa15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam228bQ497Q6 232 aa15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nol12Q8BG17 217 aa15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntnap1O54991 1385 aa15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shank2Q80Z38 1476 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mst1rQ62190 1378 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InhbeO08717 350 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NexnQ7TPW1 607 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam213aQ9CYH2 218 aa15.21■□□□□ 0.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde4dQ01063 747 aa15.21■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrt2Q8BG36 561 aa15.2■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa15.2■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr5lA2AVJ5 370 aa15.2■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mknk2Q8CDB0 459 aa15.2■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp19a1P28649 503 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf5lQ91WQ5 589 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ltbp1Q8CG19 1712 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm10P62073 90 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slf2Q6P9P0 1278 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trip6Q9Z1Y4 480 aa15.19■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan25B2RX31 543 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dctn1O08788 1281 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa3bJ9JI28 736 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irf5P56477 497 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpm2P58774 284 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E4f1Q8CCE9 783 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ush1cQ9ES64 910 aa15.18■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem87bQ8BKU8 555 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sugp2Q8CH09 1067 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fez1Q8K0X8 392 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppfibp2O35711 882 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult6b1P0CC03 303 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DbnlQ62418 436 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clca2Q8BG22 942 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcan3Q9JKK0 239 aa15.17■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcc1P97496 1104 aa15.16■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sytl4Q9R0Q1 673 aa15.16■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps33bP59016 617 aa15.16■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gzf1Q4VBD9 706 aa15.16■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esco1Q69Z69 843 aa15.16■□□□□ 0.02
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